Si, la extensión puede estar en cualquier lugar del mundo, y conectarse a la 3CX a través de internet.
Como te decía, hay cuestiones de NAT/firewall a tener en cuenta (si es que la 3CX está detrás de un NAT/firewall).
Para configurar el ATA, en general solo tenés que cargar la dirección IP pública de la 3CX, el usuario y la contraseña, pero te sugiero que leas el manual del equipo para mayor seguridad y si tenés alguna duda puntual hacenosla llegar.
Saludos.